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SSR标记、ssr标记是什么意思

2023-04-21 00:30 浏览:38

SSR分子标记是怎样进行植物基因定位的

在真核生物的基因组中,每个SSR序列的基本单元重复次数在不同基因型间差异很大,因此形成其座位的多态性,并且每个SSR座位两端有一段保守的DNA序列,可以根据此保守序列设计引物,利用PCR技术进行扩增,然后用高浓度琼脂糖凝胶或变性聚丙稀酰胺凝胶电泳进行分析.由于SSR多态性是由简单序列重复次数的差异引起的,因此在扩增的PCR带上会出现小片段或不连续的带.由此可见,SSR分子标记的基本原理就是要了解SSR座位两侧的核苷酸序列,寻找其中的特异保护区.

分子标记中显性标记与共显性标记的区别，为什么SSR可以区分杂合而RAPD就不行呢？

分子标记中显性标记与共显性标记的区别，SSR可以区分杂合而RAPD就不行是因为：在普通遗传学上，共显性定义为F1代中，双亲的性状同时表现的现象。这里与完全显性形成了区别，共显性能够将杂合体和纯合体从表现上区分开，而完全显性则不能。分子标记的共显性也就是这个意思。

显性是指一对相对性状中的显性和隐性，并且只有这里两种形状。而共显性是指除显性和隐性之外的一种形状，例如某些花卉中，显性纯合子表现出显性形状，隐性纯合子表现出隐性形状，而杂合子则表现出共显性。

应用范围

所以，共显性标记，在揭示遗传多样性方面要比显性标记具有更大的优势。更为重要的是，SSR引物是以外显子保守序列为引物结合点，即以已知DNA序列为基础所开发的引物，在基因组上具有特定的位置，所以在QTL等分析上，应用极为广泛。共显性：说白了就是可以分辨出纯和的跟杂合的。

ssr是什么意思?

ssr指SSR标记。

SSR(Simple Sequence Repeats)标记是近年来发展起来的一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术，也称为微卫星DNA(MicrosatelliteDNA),是一类由几个核苷酸（一般为1~6个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的串联重复序列。每个SSR两侧的序列一般是相对保守的单拷贝序列。

特点：

与其它分子标记相比，SSR标记具有以下优点：(1)数量丰富，覆盖整个基因组，揭示的多态性高；(2)具有多等位基因的特性，提供的信息量高；(3)以孟德尔方式遗传，呈共显性；(4)每个位点由设计的引物顺序决定，便于不同的实验室相互交流合作开发引物。

什么叫SSR标记，有何优缺点？

SSR简单序列重复标记（Simple sequence repeat, 简称SSR标记），也叫微卫星序列重复，是由一类由几个核苷酸（1-5个）为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列，长度较短，广泛分布在染色体上。由于重复单位的次数的不同或重复程度的不完全相同，造成了 SSR长度的高度变异性，由此而产生SSR标记或SSLP标记。虽然SSR在基因组上的位置不尽相同，但是其两端序列多是保守的单拷贝序列，因此可以用微卫星区域特定顺序设计成对引物，通过PCR技术，经聚丙烯酰胺凝胶电泳，即可显示SSR位点在不同个体间的多态性。

SSR标记的特点

研究发现，微卫星中重复单位的数目存在高度变异，这些变异表现为微卫星数目的整倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相同，因而造成多个位点的多态性。如果能够将这些变异揭示出来，就能发现不同的SSR在不同的种甚至不同个体间的多态性，基于这一想法，人们发展起了SSR标记。SSR标记又称为sequence tagged microsatellite site,简写为STMS，是目前最常用的微卫星标记之一。由于基因组中某一特定的微卫星的侧翼序列通常都是保守性较强的单一序列，因而可以将微卫星侧翼的DNA片段克隆、测序，然后根据微卫星的侧翼序列就可以人工合成引物进行PCR扩增，从而将单个微卫星位点扩增出来。由于单个微卫星位点重复单元在数量上的变异，个体的扩增产物在长度上的变化就产生长度的多态性，这一多态性称为简单序列重复长度多态性(SSLP)，每一扩增位点就代表了这一位点的一对等位基因。由于SSR重复数目变化很大，所以SSR标记能揭示比RFLP高得多的多态性，这就是SSR标记的原理。

ssr是什么？

SSR是Simple Sequence Repeat的缩写，意思是简单重复序列标记，SSR是以PCR技术为核心的DNA分子标记技术，或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence，MS)，或短串联重复标记( Short Tandem Repeat，STR)。

1982年，Hamade等人发现了简单重复序列标记(SSR)技术，或称微卫星序列标记(Microsatellite sequence，MS)，或短串联重复标记( Short Tandem Repeat，STR)。